С 1 ноября 1904 года Моисеев проводил достройку эскадренных броненосцев "Император Александр III" (спущен на воду 3 августа 1901 года, введён в эксплуатацию 12 октября 1903 года) и "Слава" (спущен на воду 29 августа 1903 года, введен в эксплуатацию 12 июня 1905 года) в Кронштадте.
В 1904 году за отличие произведён в младшие судостроители. В 1905-1910 годах работал в Кронштадте в качестве строителя от Балтийского завода, занимался ремонтом, модернизацией и перестройкой кораблей Балтийского флота эскадренных броненосцев «Цесаревич» и «Слава», крейсеров "Богатырь", "Алмаз", "Россия", "Олег", "Дон", "Аврора" и "Диана", транспортов "Волга" и "Самоед", учебного судна "Океан", минных крейсеров и подводных лодок. В 1907 году произведён в полковники Корпуса корабельных инженеров. В конце 1909 - начале 1910 годов осуществлял общее наблюдение за постройкой новых минных заградителей "Амур" и "Енисей".
2 августа 1910 года был назначен начальником Императорского Адмиралтейского судостроительного завода, сменил на этой должности генерал-лейтенанта
П. Е. Черниговского умершего в июле 1910 года. В 1911 году произведён в генерал-майоры. С 19 января 1914 года, после объединения Балтийского и Адмиралтейского заводов, стал управляющим нового предприятия.
22 марта 1915 года произведён в
генерал-лейтенанты Корпуса корабельных инженеров за отличную ревностную службу и особые труды, вызванные обстановкой войны со старшинством.
7 марта 1917 года, после февральской революции, был "уволен со службы с мундиром и пенсией". В 1917 году был арестован. По косвенным доказательствам был расстрелян, по другим данным - в августе 1918 года был казнён большевиками потоплением в Финском заливе на барже землечерпательного каравана.
Семья
Александр Иванович Моисеев был женат на Екатерине Александровне Минаевой. У них родилось четверо детей. Старший сын Алексей родился в 1889 году. Средний сын Павел родился 28 декабря 1894 года, окончил Морской корпус в 1914 году, стал морским офицером, 6 ноября 1914 году произведён в мичманы, служил на Балтике. Младший сын Александр, 1901 года рождения, был заключён в Петропавловскую крепость вместе с отцом, но выпущен через некоторое время в связи с несовершеннолетием. Дочь Евгения умерла в 1900 году.
Награды
орден Святой Анны 3 степени (1899);
орден Святого Станислава 2 степени (1903);
орден Святой Анны 2 степени (1907);
орден Святого Владимира 3 степени (1911);
орден Святого Станислава 1 степени (1913);
орден Святой Анны 1 степени (30 июля 1915).
светло-бронзовая медаль "В память 300-летия царствования дома Романовых" (1913);
светло-бронзовая медаль "В память 200-летия морского сражения при Гангуте" (1915);
другие медали.